O Campeonato Brasileiro da Série C terá o mesmo numero de participantes de 2006: 64 clubes, representando todos os 26 estados do Brasil e o Distrito Federal. Todos os clubes se classificaram à Série C por critérios técnicos. Além dos quatro clubes rebaixados da Série B em 2006, 60 participantes saem dos campeonatos estaduais ou de torneios seletivos (como a Copa FPF e a Taça Minas Gerais, por exemplo). A distribuição destas vagas entre os estados é definida de acordo com o Ranking Nacional de Federações da CBF.
Pernambuco, Bahia e Goiás, respectivamente sexto, sétimo e oitavo colocados no ranking, passam a contar com uma terceira vaga na Série C a partir desta temporada. A terceira vaga goiana foi confirmada apenas em maio, após o término do campeonato estadual, devido à confirmação da Federação Acreana de que nenhuma equipe do estado teria interesse em participar do torneio sem as despesas bancadas pela CBF - assim, o Acre contará com apenas um representante.
Abaixo, a relação dos participantes da Série C 2007. Os times marcados com um asterisco (*) terão as suas despesas de viagem e hospedagem bancadas pela CBF.
| Estado |
Clube |
Como se classificou |
| Acre |
Rio Branco * |
campeão do 1o. turno do estadual |

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| Alagoas |
Coruripe * |
campeão estadual |
| ASA |
3o. colocado do estadual |
| O CRB disputará a Série B. |
| O Corinthians-AL, vice-campeão estadual, abriu mão de sua vaga. |

|
| Amapá |
Amapá * |
vice-campeão estadual 2006 |

|
| Amazonas |
São Raimundo * |
rebaixado em 2006 |
| Fast Club * |
campeão do 1o. turno do estadual |
| Nacional-AM |
vice-campeão do 1o. turno do estadual |

|
| Bahia |
Bahia * |
vice-campeão estadual |
| Atlético-BA |
3o. colocado do estadual |
| Poções |
4o. colocado do estadual |
| O Vitória disputará a Série B. |

|
| Ceará |
Icasa * |
vice-campeão estadual |
| Itapipoca |
4o. colocado do estadual |
| Ceará e Fortaleza disputarão a Série B. |

|
| Distrito Federal |
Esportivo Guará * |
vice-campeão estadual |
| Ceilândia |
3o. colocado do estadual |
| Brasiliense e Gama disputarão a Série B. |

|
| Espírito Santo |
Linhares * |
campeão estadual |
| Jaguaré |
vice-campeão estadual |

|
| Goiás |
Vila Nova-GO * |
rebaixado em 2006 |
| Atlético-GO * |
campeão estadual |
| Itumbiara |
4o. colocado do estadual |
| CRAC |
5o. colocado do estadual |
| O Goiás disputará a Série A. |

|
| Maranhão |
Sampaio Corrêa * |
campeão da Taça Cidade de São Luís |
| Imperatriz |
vice-campeão da Taça Cidade de São Luís |

|
| Mato Grosso |
Cacerense * |
campeão da Copa Governador 2006 |
| Grêmio Jaciarense |
2a. melhor campanha no 1o. turno do estadual |

|
| Mato Grosso do Sul |
Águia Negra * |
campeão do 1o. turno do estadual |
| CENE |
vice-campeão do 1o. turno do estadual |

|
| Minas Gerais |
Democrata/GV * |
3o. colocado do estadual |
| Tupi |
4o. colocado do estadual |
| Villa Nova |
5o. colocado do estadual |
| Atlético e Cruzeiro disputarão a Série A. |
| O Ipatinga disputará a Série B. |

|
| Pará |
Paysandu * |
rebaixado em 2006 |
| Tuna Luso * |
vice-campeão estadual |
| Ananindeua |
3o. colocado do estadual |
| O Remo disputará a Série B. |

|
| Paraíba |
Nacional de Patos * |
campeão estadual |
| Atlético-PB |
vice-campeão estadual |

|
| Paraná |
Paranavaí * |
campeão estadual |
| Galo/ADAP |
5o. colocado do estadual |
| Roma Apucarana |
campeão da Copa 100 Anos 2006 |
| Atlético e Paraná disputarão a Série A. |
| O Coritiba disputará a Série B. |

|
| Pernambuco |
Central * |
vice-campeão estadual |
| Porto |
4o. colocado no estadual |
| Vera Cruz |
5o. colocado no estadual |
| Náutico e Sport disputarão a Série A. |
| O Santa Cruz disputará a Série B. |

|
| Piauí |
Ríver * |
campeão estadual |
| Barras-PI |
vice-campeão estadual |

|
| Rio de Janeiro |
Madureira * |
3o. colocado no estadual |
| Volta Redonda |
5o. colocado no estadual |
| Friburguense |
6o. colocado no estadual |
| América-RJ |
7o. colocado no estadual |
| Botafogo, Flamengo, Fluminense e Vasco disputarão a Série A. |

|
| Rio Grande do Norte |
ABC * |
campeão estadual |
| Potiguar/M |
3o. colocado no estadual |
| O América disputará a Série A. |

|
| Rio Grande do Sul |
Caxias * |
4o. colocado no estadual |
| Ulbra |
vice-campeão Copa FGF 2006 e 6o. colocado no estadual |
| Esportivo |
6o. colocado no estadual |
| Grêmio, Inter e Juventude disputarão a Série A. |
| O Veranópolis, 3o. colocado do estadual, abriu mão de sua vaga. |

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| Rondônia |
Jaruense * |
campeão da 1a. fase do estadual |

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| Roraima |
São Raimundo * |
vice-campeão estadual 2006 |

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| São Paulo |
Guarani * |
rebaixado em 2006 |
| Bragantino * |
vice-campeão da Copa FPF 2006 e 4o. colocado do estadual |
| Noroeste |
7o. colocado no estadual |
| Rio Claro |
12o. colocado no estadual |
| Juventus |
13o. colocado no estadual |
| Sertãozinho |
16o. colocado no estadual |
| |
| Corinthians, Palmeiras, Santos e São Paulo disputarão a Série A. |
| Grêmio Barueri, Ituano, Marília, Paulista, Ponte Preta, Portugesa, Santo André e São Caetano disputarão a Série B. |
| O Guaratinguetá, 10o. colocado do estadual, abriu mão de sua vaga. |

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| Santa Catarina |
Chapecoense* |
campeão estadual |
| Joinville |
campeão do Torneio Seletivo 2006 |
| O Figueirense disputará a Série A. |
| Avaí e Criciúma disputarão a Série B. |

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| Sergipe |
América-SE * |
campeão estadual |
| Confiança |
vice-campeão estadual |

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| Tocantins |
Tocantinópolis * |
vice-campeão estadual 2006 |

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